Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP8AP2Q9UKL3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms