Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms