Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CGGBP1Q9UFW8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms