Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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RNF7Q9UBF6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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RNF7Q9UBF6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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RNF7Q9UBF6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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RNF7Q9UBF6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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