Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms