Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC180Q9P1Z9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms