Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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