Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EHD3Q9NZN3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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