Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms