Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms