Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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UBQLN4Q9NRR5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBQLN4Q9NRR5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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UBQLN4Q9NRR5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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UBQLN4Q9NRR5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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UBQLN4Q9NRR5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBQLN4Q9NRR5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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