Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL3Q9NQ33 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms