Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms