Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms