Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms