Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms