Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ROPN1BQ9BZX4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms