Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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