Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms