Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms