Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA5Q9BWX5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms