Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms