Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB2BQ9BVA1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms