Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PAGR1Q9BTK6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAGR1Q9BTK6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAGR1Q9BTK6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAGR1Q9BTK6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAGR1Q9BTK6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms