Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms