Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms