Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3GL2Q99962 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3GL2Q99962 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms