Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A3Q99624 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms