Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRIMPOLQ96LW4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms