Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms