Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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