Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms