Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYTL4Q96C24 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms