Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms