Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms