Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms