Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATL1Q8WXF7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms