Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FDCSPQ8NFU4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms