Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ZNF439Q8NDP4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ZNF439Q8NDP4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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