Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms