Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms