Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms