Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms