Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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