Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms