Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms