Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms