Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms