Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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