Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
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